La maracuyá morada se recoge según el desarrollo del color de la piel, mientras que en la variedad amarilla los frutos se recogen del suelo. La corteza dura o "cáscara" puede arrugarse, pero esto no indica un deterioro de la calidad interna. En su interior hay numerosas semillas rodeadas de una pulpa jugosa, aromática y amarillenta. Las semillas son lo suficientemente pequeñas como para comerse junto con la pulpa; También existe una importante industria del jugo de maracuyá.
La maracuyá amarilla debe almacenarse entre 7°C y 10°C con una humedad relativa del 90% al 95%. Tendrán una vida útil potencial de almacenamiento de 3 a 5 semanas. La maracuyá morada tolera el frío y se puede almacenar entre 5 °C y 7 °C durante 3 a 5 semanas. El daño por frío ocurre a 5°C o menos. Los síntomas de daño por frío en la maracuyá amarilla son decoloración de la piel, picaduras, áreas empapadas de agua, maduración desigual y mayor descomposición. La decoloración puede penetrar la piel hasta el exocarpio. El marchitamiento, la fermentación de la pulpa y el ataque de hongos son los principales problemas poscosecha. El marchitamiento se debe a la pérdida de humedad sin afectar inicialmente de manera significativa la calidad de la pulpa.
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